Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cldn5O54942 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cldn5O54942 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cldn5O54942 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms