Protein–RNA interactions for Protein: O54851

Gjd2, Gap junction delta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd2O54851 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjd2O54851 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms