Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DffaO54786 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DffaO54786 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DffaO54786 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DffaO54786 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DffaO54786 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DffaO54786 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DffaO54786 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DffaO54786 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DffaO54786 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DffaO54786 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DffaO54786 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DffaO54786 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DffaO54786 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DffaO54786 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DffaO54786 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DffaO54786 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DffaO54786 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DffaO54786 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DffaO54786 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DffaO54786 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DffaO54786 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DffaO54786 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DffaO54786 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DffaO54786 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DffaO54786 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DffaO54786 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DffaO54786 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DffaO54786 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DffaO54786 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DffaO54786 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DffaO54786 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DffaO54786 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DffaO54786 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DffaO54786 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DffaO54786 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DffaO54786 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DffaO54786 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DffaO54786 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DffaO54786 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DffaO54786 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DffaO54786 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DffaO54786 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DffaO54786 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DffaO54786 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DffaO54786 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DffaO54786 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DffaO54786 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DffaO54786 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DffaO54786 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DffaO54786 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DffaO54786 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DffaO54786 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DffaO54786 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DffaO54786 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DffaO54786 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DffaO54786 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DffaO54786 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DffaO54786 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DffaO54786 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DffaO54786 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DffaO54786 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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DffaO54786 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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DffaO54786 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DffaO54786 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DffaO54786 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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DffaO54786 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffaO54786 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffaO54786 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffaO54786 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffaO54786 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffaO54786 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffaO54786 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffaO54786 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffaO54786 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffaO54786 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffaO54786 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffaO54786 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffaO54786 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffaO54786 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DffaO54786 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffaO54786 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffaO54786 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffaO54786 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffaO54786 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DffaO54786 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffaO54786 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffaO54786 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffaO54786 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffaO54786 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffaO54786 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffaO54786 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffaO54786 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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