Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Edil3O35474 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Edil3O35474 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Edil3O35474 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Edil3O35474 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Edil3O35474 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Edil3O35474 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Edil3O35474 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Edil3O35474 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Edil3O35474 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Edil3O35474 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Edil3O35474 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Edil3O35474 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Edil3O35474 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Edil3O35474 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Edil3O35474 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Edil3O35474 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Edil3O35474 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Edil3O35474 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Edil3O35474 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Edil3O35474 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Edil3O35474 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Edil3O35474 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Edil3O35474 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Edil3O35474 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Edil3O35474 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Edil3O35474 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Edil3O35474 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edil3O35474 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edil3O35474 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Edil3O35474 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edil3O35474 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edil3O35474 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edil3O35474 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edil3O35474 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Edil3O35474 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edil3O35474 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edil3O35474 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edil3O35474 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edil3O35474 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edil3O35474 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Edil3O35474 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edil3O35474 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edil3O35474 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Edil3O35474 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Edil3O35474 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Edil3O35474 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edil3O35474 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Edil3O35474 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edil3O35474 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edil3O35474 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edil3O35474 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edil3O35474 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edil3O35474 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edil3O35474 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edil3O35474 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edil3O35474 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edil3O35474 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edil3O35474 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms