Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TnxbO35452 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TnxbO35452 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TnxbO35452 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms