Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe40O35185 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms