Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms