Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms