Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm379J3QQ19 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm379J3QQ19 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm379J3QQ19 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm379J3QQ19 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm379J3QQ19 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Gm379J3QQ19 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Gm379J3QQ19 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Gm379J3QQ19 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Gm379J3QQ19 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Gm379J3QQ19 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Gm379J3QQ19 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gm379J3QQ19 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm379J3QQ19 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gm379J3QQ19 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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