Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccer2J3QPU5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms