Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms