Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp616J3QN14 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp616J3QN14 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp616J3QN14 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp616J3QN14 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp616J3QN14 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp616J3QN14 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp616J3QN14 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Zfp616J3QN14 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Zfp616J3QN14 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Zfp616J3QN14 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Zfp616J3QN14 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Zfp616J3QN14 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Zfp616J3QN14 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Zfp616J3QN14 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Zfp616J3QN14 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp616J3QN14 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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