Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Gm3336J3QMQ6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Gm3336J3QMQ6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Gm3336J3QMQ6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Gm3336J3QMQ6 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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