Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK1

Sgo2b, Shugoshin 2B, mousemouse

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Length 1,167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2bJ3QMK1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2bJ3QMK1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2bJ3QMK1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2bJ3QMK1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2bJ3QMK1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2bJ3QMK1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2bJ3QMK1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2bJ3QMK1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2bJ3QMK1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2bJ3QMK1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2bJ3QMK1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2bJ3QMK1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2bJ3QMK1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2bJ3QMK1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2bJ3QMK1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2bJ3QMK1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2bJ3QMK1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2bJ3QMK1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2bJ3QMK1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2bJ3QMK1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2bJ3QMK1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2bJ3QMK1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2bJ3QMK1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2bJ3QMK1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2bJ3QMK1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2bJ3QMK1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2bJ3QMK1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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