Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms