Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Taf4bG5E8Z2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Taf4bG5E8Z2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Taf4bG5E8Z2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Taf4bG5E8Z2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Taf4bG5E8Z2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Taf4bG5E8Z2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms