Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Cldn20G5E8X0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Cldn20G5E8X0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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Cldn20G5E8X0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Cldn20G5E8X0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Cldn20G5E8X0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Cldn20G5E8X0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Cldn20G5E8X0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Cldn20G5E8X0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Cldn20G5E8X0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Cldn20G5E8X0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Cldn20G5E8X0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn20G5E8X0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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