Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp17ldG5E8G2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms