Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
Trim55G3X8Y1 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim55G3X8Y1 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim55G3X8Y1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim55G3X8Y1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim55G3X8Y1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim55G3X8Y1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim55G3X8Y1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim55G3X8Y1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim55G3X8Y1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim55G3X8Y1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim55G3X8Y1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim55G3X8Y1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms