Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms