Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34aG3UW52 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34aG3UW52 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34aG3UW52 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34aG3UW52 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34aG3UW52 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34aG3UW52 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34aG3UW52 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34aG3UW52 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34aG3UW52 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34aG3UW52 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34aG3UW52 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms