Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5160F8VPN3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms