Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms