Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Gm28038F7BCN9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Gm28038F7BCN9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Gm28038F7BCN9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Gm28038F7BCN9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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