Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28048F7BCN0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28048F7BCN0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28048F7BCN0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28048F7BCN0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28048F7BCN0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28048F7BCN0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28048F7BCN0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28048F7BCN0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28048F7BCN0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28048F7BCN0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28048F7BCN0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28048F7BCN0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28048F7BCN0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28048F7BCN0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28048F7BCN0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28048F7BCN0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28048F7BCN0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28048F7BCN0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28048F7BCN0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28048F7BCN0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28048F7BCN0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28048F7BCN0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28048F7BCN0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28048F7BCN0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28048F7BCN0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28048F7BCN0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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