Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9S8

Gm2564, C-C motif chemokine, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2564F6Z9S8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm2564F6Z9S8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm2564F6Z9S8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Gm2564F6Z9S8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Gm2564F6Z9S8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Gm2564F6Z9S8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2564F6Z9S8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2564F6Z9S8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm2564F6Z9S8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2564F6Z9S8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2564F6Z9S8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2564F6Z9S8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm2564F6Z9S8 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2564F6Z9S8 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2564F6Z9S8 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2564F6Z9S8 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2564F6Z9S8 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2564F6Z9S8 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2564F6Z9S8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2564F6Z9S8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2564F6Z9S8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2564F6Z9S8 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2564F6Z9S8 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2564F6Z9S8 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2564F6Z9S8 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2564F6Z9S8 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2564F6Z9S8 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2564F6Z9S8 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2564F6Z9S8 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2564F6Z9S8 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2564F6Z9S8 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm2564F6Z9S8 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms