Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms