Protein–RNA interactions for Protein: F6X8D5

Gm42421, Predicted gene, 42421 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42421F6X8D5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm42421F6X8D5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm42421F6X8D5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm42421F6X8D5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm42421F6X8D5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm42421F6X8D5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm42421F6X8D5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm42421F6X8D5 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm42421F6X8D5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm42421F6X8D5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm42421F6X8D5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm42421F6X8D5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm42421F6X8D5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm42421F6X8D5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm42421F6X8D5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms