Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms