Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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