Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms