Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms