Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms