Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

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Length 693 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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TrdnE9Q9K5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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TrdnE9Q9K5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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TrdnE9Q9K5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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TrdnE9Q9K5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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TrdnE9Q9K5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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TrdnE9Q9K5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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TrdnE9Q9K5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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TrdnE9Q9K5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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