Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms