Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Vmn1r238E9Q373 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Vmn1r238E9Q373 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r238E9Q373 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r238E9Q373 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r238E9Q373 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r238E9Q373 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r238E9Q373 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r238E9Q373 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r238E9Q373 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r238E9Q373 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Vmn1r238E9Q373 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r238E9Q373 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r238E9Q373 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r238E9Q373 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r238E9Q373 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r238E9Q373 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r238E9Q373 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Vmn1r238E9Q373 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r238E9Q373 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r238E9Q373 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r238E9Q373 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r238E9Q373 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r238E9Q373 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Vmn1r238E9Q373 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Vmn1r238E9Q373 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r238E9Q373 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Vmn1r238E9Q373 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Vmn1r238E9Q373 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Vmn1r238E9Q373 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r238E9Q373 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Vmn1r238E9Q373 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r238E9Q373 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r238E9Q373 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r238E9Q373 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r238E9Q373 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r238E9Q373 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r238E9Q373 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r238E9Q373 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r238E9Q373 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r238E9Q373 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r238E9Q373 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r238E9Q373 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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