Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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Pdzd2E9Q1M1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Pdzd2E9Q1M1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Pdzd2E9Q1M1 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Pdzd2E9Q1M1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Pdzd2E9Q1M1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Pdzd2E9Q1M1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Pdzd2E9Q1M1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Pdzd2E9Q1M1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Pdzd2E9Q1M1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Pdzd2E9Q1M1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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