Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms