Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms