Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms