Protein–RNA interactions for Protein: E9PV04

Gm8994, Predicted gene 8994, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8994E9PV04 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms