Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms