Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms