Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms