Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Atp6ap1lD3Z5W0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp6ap1lD3Z5W0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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