Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms