Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms