Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms