Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Gm17333C6EQI3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Gm17333C6EQI3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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