Protein–RNA interactions for Protein: B9EJU1

Gm1141, Gene model 1141, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1141B9EJU1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm1141B9EJU1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1141B9EJU1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms